晶報(bào)2019年2月13日訊(記者王子鍵)近期,賀歲電影《瘋狂的外星人》成為人們熱聊的話題。在電影中,外星人與地球人通過交換“基因球”的方式建立外交關(guān)系,如此神奇的“基因球”,技術(shù)上可行嗎?中國(guó)目前的基因測(cè)序技術(shù)發(fā)展情況又是如何呢?晶報(bào)記者就此采訪了華大智造測(cè)序儀產(chǎn)品經(jīng)理汪婧婧博士。
“基因球”和“口腔拭子”有很多相似之處
汪婧婧表示,電影中的這顆“基因球”兼具了樣本的采集和存儲(chǔ)能力,雖然和電影里“基因球”一模一樣的產(chǎn)品目前還不存在,但它作為一種虛擬的采樣方式,其實(shí)與我們現(xiàn)在常用的“口腔拭子”有很多相似之處。
據(jù)了解,“口腔拭子采集器”目前在基因樣本采集中已有一定規(guī)模的應(yīng)用,“人的唾液中含有口腔上皮細(xì)胞和白細(xì)胞,這些細(xì)胞內(nèi)含有細(xì)胞核,細(xì)胞核內(nèi)含有遺傳物質(zhì)(基因組DNA)。因此,通過采集唾液樣本,是可以獲取人類基因的。而且,只要唾液中細(xì)胞的DNA量能滿足一次建庫(kù)測(cè)序的需要,口腔中的唾液是可以做一個(gè)人的全部基因測(cè)序的。”汪婧婧說。
這些原始樣本會(huì)經(jīng)過一系列人工或者自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)操作完成核酸提取和測(cè)序文庫(kù)制備,最終進(jìn)入測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序。汪婧婧認(rèn)為,目前大部分的樣本采集-核酸提取-測(cè)序文庫(kù)制備到測(cè)序都是獨(dú)立的流程和設(shè)備,全流程一體化從樣本到報(bào)告是發(fā)展趨勢(shì)。
最快一天內(nèi)可完成個(gè)人全基因組測(cè)序
晶報(bào)記者了解到,作為20世紀(jì)三大科學(xué)工程之一的人類基因組計(jì)劃,于1990年正式啟動(dòng),它基于半自動(dòng)化的Sanger測(cè)序技術(shù),用了13年的時(shí)間,花費(fèi)了30億美元才完成第一個(gè)人的全基因組框架圖繪制。高昂的測(cè)序成本和漫長(zhǎng)的測(cè)序時(shí)間曾是制約基因測(cè)序技術(shù)大規(guī)模應(yīng)用的主要因素。
汪婧婧表示,短短20年間,基因組研究已經(jīng)進(jìn)入了高通量測(cè)序時(shí)代,通過不同的技術(shù)路線制備DNA測(cè)序模版,然后進(jìn)行先進(jìn)的大規(guī)模并行測(cè)序,實(shí)現(xiàn)了測(cè)序時(shí)間和成本的大大降低。她介紹,華大智造的DNBSeq采用了微陣列DNA納米測(cè)序技術(shù),通過超高密度微陣列芯片和PCR-free DNA納米球技術(shù)(DNB, DNA Nanoballs)的整合可以實(shí)現(xiàn)高精度基因測(cè)序。完成一個(gè)人全基因組的測(cè)序時(shí)間從幾天到24小時(shí)內(nèi)不等,測(cè)序成本也降到600美金以下。
“可以說,從1999年到2019年,全球基因測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展已經(jīng)超越了科幻電影的想象力,而中國(guó)基因測(cè)序技術(shù)也在這20年間,從一個(gè)追隨者開始變成領(lǐng)跑者?!蓖翩烘赫J(rèn)為,隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展日新月異,科幻電影中“基因球”這么小體積的兼具提取+測(cè)序+儲(chǔ)存能力的設(shè)備,在未來是非常有可能實(shí)現(xiàn)的,這也將是全球人類進(jìn)入“人人基因組時(shí)代”的加速器。